转眼又是百余年的时间，那些第三魔法领悟者的弟子们，渐渐的感到绝望了，他们纷纷选择了放弃，离开了这片伤心之地，只留下了那一具玩偶，和一些在数百年间弟子们不停仿制玩偶时失败的造物，相当数量的人造人们，依旧坚持不懈留在那里，想要重现第三魔法。
时间推演到了无数年之后，也就是在未来的一个时间点上，一个怀揣着复兴魔法时代伟大梦想的年轻魔术师，机缘巧合之下，进入了玩偶所在的那片领地，并且结识了依旧在坚持不懈的尝试着，想要重现第三魔法的玩偶，两者不谋而合的决定，尝试着通过一个仪式，重现第三魔法。
只不过，因为当时人偶并没有被激活，还不算是一个生命，所以无论是盖亚，还是阿赖耶，都完全没有注意到那具人偶的特殊性，直到许多年以后，那些在第三魔法领悟者陨落之后，四散到各地的弟子们，心有不甘的重新回到了，他们老师曾经教导他们的地方，在那里找到了那具人偶，并花费了数百年时间，将那具人偶成功激活之后，灵魂物质化魔法才再度出现在了世人的视野之中。
虽然人偶成功被激活了，但是这具人偶本身所继承的第三魔法并不完整，每次使用灵魂物质化魔法，不仅在效果上完全不能和第三魔法的领悟者本人使用的魔法相提并论，而且还要历经数十年的漫长冷却时间，才能再次使用，再加上玩偶也根本没有办法离开，这一片她曾经被制造出来的范围之外，否则就会急速衰老，最终灭亡，这当然也是后来，阿赖耶和盖亚注意到玩偶的存在时，没有过多去理会的原因。
这些混乱的时间线被世界记录了下来，从而又导致了许多虚假错乱的历史产生，而这些错乱的历史所引发的动荡，甚至足以更改整个人类文明的进程，这个结果自然也是有好有坏，好的结果可能会让人类变得更加繁荣了，而坏的结果，则可能导致人类在未来被灭绝了，甚至于连星球，都有可能被影响到。
而且，随着这些英灵的乱入和时间线的混乱，使得盖亚对神秘力量的封锁也出现了漏洞，有的人类借助着英灵的力量，成功沟通了他们本不应感知到的根源之地，窃取了被盖亚封印在那里的魔法知识，从而在神秘力量不断消褪的大环境下，再度诞生出了一些拥有超凡之力的人类，这些人类中，甚至于还包括了五个成功领悟出涉及了世界根源法则魔法的，这种超乎常规的不合理存在，而根据这五个人领悟魔法的先后顺序，这五种涉及了世界根源法则的魔法，则被冠以了第一魔法到第五魔法之名。
问题出现在了第三魔法的领悟者上面，所谓的第三魔法，也就是灵魂物质化魔法，换言之，就是可以随时用魔力构筑肉体或者是躯壳，同时又将灵魂化身为永动机一样的存在，拥有着无穷无尽的魔力，可以不停地构筑出各种物质，达到另一种意义上的不死不灭的魔法。