这时，正片开始。
剧情的开头讲述了在天空于人类世界深海相连之处居住着一群能够掌控自然规律的人们。
一名叫做椿的少女在十六岁生日的那天化身为鱼，和同伴们一起去人间的大海里巡游七日，观察他们掌管的自然规律。
在大海中巡游的时候，椿被一张渔网困住。
一个小男孩发现之后，纵身跃入大海之中，将椿解救了出来，但是男孩却被海水冲走因此丧命。
目睹这一切的椿十分的愧疚，她知道，男孩的妹妹还在家里等着哥哥回来，但是男孩却已经葬身在海底，再也回不去了。
内心愧疚不已的椿知道，她可以将男孩复活。
每一个人死后，他的灵魂就化身为一条小鱼进入他们所居住的世界，这条小鱼由灵婆来掌管，只要她找到这条鱼，在特定的时候回归人类世界，男孩就会复活。
如果真的这样做，那她就触犯了世界的规则，天神将会惩罚他们居住的世界。
但是，椿依旧这样做了，她偷偷的找到了那条小鱼，将自己一半的寿命给了他，并将其取名为鲲。
这件事被椿的青梅竹马湫发现，一直深深爱着椿的湫并没有将这件事告诉村民，而是一直在帮助椿隐瞒这件事。
但是纸包不住火，椿的行为最终被村民发现，他们要求椿的父母交出椿，并准备处死鲲。
但是椿与鲲之间的性命相连，鲲死，椿也死！
为了能够让鲲回到人间，湫在法力不足以支撑开天的条件下打开了海天之门，最后导致海水倒灌，海底世界的天变得千疮百孔。
人们流离失所，族长带着村民们全都跑到最高的地方避难，椿的爷爷为了解救村民化身一株巨大的海棠树，在这但是这任然不足以消弭灾难。
椿不忍心因为自己的过而让族人承受苦难，看着自己闯下的大祸，椿决定牺牲生命来弥补自己的错误，然后椿就依附在爷爷死去后变成的海棠树根部，椿慢慢释放着自己的生命能量，不一会儿已经枯死的海棠树就长成了枝繁叶茂与天平齐的参天大树，然后茂密的树枝在天的缺口处不断扩散，直到把所有的缺口全都堵住了。
但是椿也消失在了海棠树中。
湫为了让椿复活，找到灵婆，提出要拿出自己一半的生命复活椿。
可灵婆却要他全部的生命，因为椿一半的生命在鲲的身上，两人性命相连，湫一半的生命没办法复活两人。
湫答应了灵婆的条件，将椿和鲲送回人类世界之后，就将自己全部的生命交给灵婆。
影片的最后，湫燃烧了自己强行打开海天之门，让椿和鲲一起回到了人类的世界。
一个人类为了一条鱼舍弃了自己的生命，一个半神为了一个人类放弃了所有，一个天神为了成全一个半神燃烧了自己全部的生命。
影片结束后，众人感觉自己的鼻子有点发酸。
但是真正让在场的观众忍不住落泪的是一首随着浪花翻涌而出的歌声。
“海浪无声将夜幕深深淹没。”
“漫过天空尽头的角落。”
“大鱼在梦境的缝隙里游过，凝望你沉睡的轮廓。”
“……”
叮咚的琴声阵阵响起。
低沉婉转的歌声在影厅中回荡。
听着这如同是从灵魂深处冒出一般的歌声，叶子瑜抓着爆米花的手僵在了半空中，她的灵魂犹如是被一道闪电击中了一般，整个人都呆住了。