排除了三杨这一批成宣时期的臣子后，以哪个臣子作为紫阁功臣之首，那就很好选了。
很多人都想到了一个名字：于谦。
这个人的功绩，可以说是怎么夸赞都不为过。土木堡之变后，正是在于谦主持下，大明取得了北京保卫战的胜利，免去了一次可能堪比靖康之耻的大祸，没有让那时的大明，像宋朝成为南明。
可以说，于谦在很多人心目中，都是功勋卓著的名臣。再加上他含冤而死，被很多人同情。紫阁中的臣子，都想到了皇帝想把于谦，列在功臣首位。
和于谦一样担任兵部尚书、而且和当年的于谦一样作为九卿之首，袁可立率先说道：
“于忠肃公有功于国，当为紫阁功臣！”
群臣纷纷附和，认为于谦应该是紫阁功臣。
朱由检对此表示赞同，当即向群臣道：
“于少保有功于国，确实应该是紫阁功臣。”
又口占一诗，向群臣道：
“江山也要伟人扶，神化丹青即画图。”
“赖有岳于双少保，人间始觉重西湖。”
“于忠肃公，就是大明的岳武穆。”
“董侍郎，由你为于忠肃公画像，悬挂紫阁之中。”
“朕要让后人记住，于谦是社稷功臣！”
对于于谦这个人，不是没有争议。主要的争议点，就是于谦是否是忠臣。
毕竟在英宗皇帝被俘后，于谦不顾瓦剌的要挟，请皇太后立郕王为皇帝。所以一些人认为，于谦对英宗皇帝不忠。
然后在景泰皇帝病重时，于谦手握兵权，却又在夺门之变时毫无作为，坐视景泰皇帝被废。被一些人认为，于谦对景泰皇帝不忠。
这两件事，让于谦受到一些非议，认为他不是一个忠臣。
但是从于谦束手就缚、含冤而死来看，朱由检认为他是忠臣。只不过他忠于不是某位皇帝，而是大明社稷。
所以朱由检称于谦社稷功臣，列在紫阁首位。他要用这个做法，表明自己的态度。
对于谦排在这个位置，群臣大多是服气的。就连之前把三杨列在首位的内阁大学士，也提不出异议。
毕竟于谦的功劳实在太大了，皇帝说他是扶保江山的伟人，那是毫不为过。
而且因为于谦含冤而死，和岳飞的结局相似，深受人们同情。
以于谦作为功臣首位，能把紫阁功臣的名声，在天下间很快确立。如果有哪个紫阁功臣的名字不太知名，只需要说一句“他和于谦一样都是紫阁功臣”，就能让人知道，这个人有多大功绩。
朱由检也是因此，把于谦放在首位。总不能像宋朝的昭勋阁那样，列了一堆不怎么知名的人，却把寇准、范仲淹、狄青、岳飞等人，尽皆排除在外
事实证明，岳飞英名不朽，宋理宗设立的昭勋阁，则是少有人知。
朱由检设立紫阁，当然不能犯这样的错误。所以他坚决否定了三杨，把于谦列在首位。
而且为了鼓励群臣立功，朱由检还要对于谦大力褒扬，要让人们知道，自己对功臣的态度：
“国初之时，多有功臣被追赠国公、郡公者。”
“朕以为凭于谦的功绩，也应追赠国公。”