林青玄改司教院为布道院，布道院管理玉泉门下属所有布道场，负责弟子的招收，最初五年的教育。
认命丘平为布道院院长，直接向掌门林青玄负责。
设立暗堂，认命王铮为暗堂堂主，掌管玉泉门对外刺探，情报收集，暗中监查，直接向掌门林青玄负责。
执法堂堂主柳依依，掌管宗门刑法，维护玉泉门门规，直接向掌门林青玄负责。
改组庶务堂，牛能仍为庶务堂堂主，设立灵兽司负责灵兽驯养，设任务司负责任务发布与奖励发放，设内务司负责修炼资源发放，奖励兑换，杂役管理，各种大典筹办等等，设外物司负责统筹资源开采，接受上交资源，修仙坊市管理等等。
改炼丹阁为炼丹殿，由三阶下品炼丹大师丘平暂代殿主，改炼器阁为炼器殿，由三阶上品炼器大师柳依依暂代殿主，改阵法阁为阵法殿，由三阶上品阵法大师牛能暂代殿主，改制符阁为制符殿，由林青玄自己暂代殿主，每殿又下设诸多讲师。
每日每殿都有讲师前去授课，每隔一段时间更有殿主亲自授课，凡有意学习修仙技艺的弟子皆可前往听课。
如此，四阁改四殿之后，四殿原本的权力几乎去了九成。
之前的四阁制，算是将玉泉门的弟子分别归属到了四阁之下，四阁拥有调遣阁中弟子等诸多权力。
而四殿制，使得四殿只有教授弟子和组织炼丹炼器，以及布阵画符的权力。
说白了，就是一个让门下弟子学习的地方，任何弟子皆可去。
认命韩聪为暂时藏经阁阁主，十年之后再行更换。
藏经阁阁主不同于其他职位，需要长时间留在藏经阁内，但凡有追求的修仙者，基本都不会选择镇守藏经阁。
当年，林青玄去参加烈阳宗杜九娘的金丹大典时，心中就震惊于烈阳宗的功勋制度。
故而，此次他在玉泉门中设立功勋制度，弟子完成任务奖励相应的功勋点，功勋点在玉泉门内取代原本的灵石，只要功勋点足够，便可以从门中换取自己需要的宝物。
功勋点适用玉泉门的所有修士，上至掌门林青玄，下到杂役弟子都要遵循。
而功勋点的来源众多，就任各个职位，完成各种任务，以及对玉泉门有贡献的行为都将奖励功勋点。
玉泉门的功勋制度由庶务堂负责，下属四司分管。
功勋制度的出现，使得玉泉门在门派修仙势力的道路迈出一大步，让门中弟子对玉泉门更加依赖，增强了众弟子对门派的认同感，呈现出了空前的团结。
林青玄定假丹期修士才可为长老，遂降柳依依，牛能，韩聪，姜颖，王铮丘平六人为执事，练气期修士可为管事。
当然了，六人也只是名号从长老变成了管事，实际权利一点儿没有少。
同时设立杂役，外面，内门，核心四等，核心弟子只设十人，首要条件便是六十岁前达到练气九层，而单灵根与异灵根弟子必为核心弟子
硬性规定筑基期修士至少收徒三人，其弟子又可分为记名，普通，亲传三等，而筑基期修士只能有一名亲传弟子。
不论年龄，不论修为，只要为亲传弟子便可以享受内门弟子的待遇，至于记名与普通弟子就没有门派优待了。
随着一系列的改革之后，玉泉门进入了飞速大发展时期。
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